Ένα από τα κοινά ζητήματα όσον αφορά τα κοπάδια της αυλής σχετίζεται με φτωχά ή ανεπαρκή προγράμματα διατροφής που μπορούν να οδηγήσουν σε ελλείψεις βιταμίνης και ορυκτών για τα πουλιά. Οι βιταμίνες και τα ορυκτά είναι πολύ σημαντικά συστατικά μιας δίαιτας κοτόπουλων και εκτός εάν ένα διαμορφωμένο σιτηρέσιο είναι ζωοτροφές, είναι πιθανό ότι θα συμβούν ελλείψεις.

Τα πουλερικά απαιτούν όλες τις γνωστές βιταμίνες εκτός από το C. Ορισμένες βιταμίνες είναι διαλυτές στα λίπη, ενώ άλλα είναι διαλυτά στο νερό. Μερικά από τα συμπτώματα μιας ανεπάρκειας βιταμινών έχουν ως εξής:
Λιές διαλυτές βιταμίνες
Βιταμίνη Α Μειωμένη παραγωγή αυγών, αδυναμία και έλλειψη ανάπτυξης
Βιταμίνη D Λεπτό κέλυφος αυγά, μειωμένη παραγωγή αυγών, καθυστερημένη ανάπτυξη, rickets
Βιταμίνη Ε διευρυνόμενες αγκώνες, εγκεφαλομαλακία (ασθένεια Crazy Chick)
Βιταμίνη Κ παρατεταμένη πήξη αίματος, ενδομυϊκή αιμορραγία
 
Υδατοδιαλυτές βιταμίνες
Θιαμίνη (B1) Απώλεια της όρεξης και του θανάτου
Ριβοφλαβίνη (B2) Η παράλυση σγουρής, η κακή ανάπτυξη και η κακή παραγωγή αυγών
Δερματίτιδα παντοθενικού οξέος και βλάβες στο στόμα και τα πόδια
Τα πόδια της νιασίνης, η φλεγμονή της γλώσσας και της κοιλότητας του στόματος
Κακή ανάπτυξη χολίνης, λιπώδη ήπαρ, μειωμένη παραγωγή αυγών
Αναιμία βιταμίνης Β12, κακή ανάπτυξη, εμβρυϊκή θνησιμότητα
Η κακή ανάπτυξη του φολικού οξέος, η αναιμία, η φτωχή παραγωγή φτερού και αυγών
Βιοτίνη δερματίτιδα στα πόδια και γύρω από τα μάτια και το ράμφος
Τα ορυκτά είναι επίσης σημαντικά για την υγεία και την ευημερία των πουλερικών. Τα παρακάτω είναι μερικά από τα σημαντικά ορυκτά και τα συμπτώματα των ορυκτών ελλείψεων:
Ορυκτά
Κακή ποιότητα κελύφους αυγού ασβεστίου και κακή εκκόλαψη, rickets
Φωσφόρος rickets, κακή ποιότητα και εκκολαπτόμενο κέλυφος αυγών
Ξαφνικό θάνατο μαγνησίου
Μανγκάνη, κακή εκκόλαψη
Αναιμία σιδήρου
Αναιμία χαλκού
Ιώδιο goitre
Ψευδάργυρος φτωχός φτερά, μικρά οστά
Κόκο αργή ανάπτυξη, θνησιμότητα, μειωμένη εκκόλαψη
Όπως αναφέρθηκε παραπάνω, οι ελλείψεις βιταμίνης και ορυκτών μπορούν να παράγουν πολυάριθμα προβλήματα υγείας για τα κοτόπουλα, συμπεριλαμβανομένων σε ορισμένες περιπτώσεις, του θανάτου. Έτσι, για να αποφευχθούν οι διατροφικές ανεπάρκειες ή όταν παρατηρούνται συμπτώματα ανεπάρκειας, πρέπει να εφαρμόζονται μια ισορροπημένη δίαιτα πουλερικών με τις απαιτούμενες βιταμίνες και μέταλλα.